Образовательная магистерская программа «Инновационные технологии в АПК» обеспечивает формирование профессиональных компетенций и навыков в области растениеводства, биологической защиты растений и сельскохозяйственной биотехнологии. Данная магистерская программа направлена на решение комплексных задач по организации и производству высококачественной продукции растениеводства, а также консультационную деятельность для работы в сельскохозяйственных предприятиях различных форм собственности, научно-исследовательских институтах и лабораториях сельскохозяйственного и биотехнологического профиля, селекционных центрах, лабораториях, осуществляющих производство биопрепаратов, информационно-консультационных службах, высших учебных заведениях.
Студенты направления изучают ботанику, физиологию и биохимию растений, микробиологию, агрометеорологию, почвоведение и основы геологии, земледелие, агрохимию, растениеводство. Агрономы создают новые виды огородных, садовых и полевых культур, внедряют в сельское хозяйство новые технологии.